Podle polohy poslední nenasycené vazby rozlišujeme tzv. omega-3 a omega-6 esenciální MK. Mezi omega-3 MK patří např. kyselina alfa-linolenová (ALA), eikosapentaenová (EPA), dokosahexaenová (DHA). Zdroje omega-3 MK jsou mořské ryby a jiní mořští živočichové, vlašské ořechy, řepka, soja (a oleje z nich). Mezi omega-6 MK patří kyselina gama-linolenová (GLA), linolová (LA), arachidonová (AA).